Havalandırma ve iklimlendirme sistemleri, entegre et ve süt tesisi projelerinde verimlilik ve kalite için çok önemli bir yere sahiptir. Kesimhane, et parçalama, ileri işlem, sakatat işleme, süt tesislerinin işlenmesi vs alanlarda ortam sıcaklığı kontrol altında tutulmalıdır. Her bölümde kesilecek hayvan ve işlenecek etin/sütün kapasitesine göre her mahaldeki havalandırma kayıpları, ortama ısı yayacak cihazlar, çalışacak personel sayısı, ışıklandırma vs göz önünde bulundurularak yapılan mühendislik hesaplamaları ile istenen sıcaklık değeri homojen olarak sağlanır, fire oranı minimum düzeyde tutulur ve termal koşul nedeniyle oluşacak bakterilerin oluşması engellenir.